产品简介
PhenoPixel 是专为细菌单细胞显微镜数据分析设计的 Web 平台，支持上传 ND2 文件，自动提取细胞轮廓、标注、可视化和批量表型分析，帮助研究人员高效处理显微镜图像数据，适合生物科研人员和实验室使用。
核心功能
- ND2 文件管理：上传、解析和查看显微镜文件
- 自动细胞提取：生成裁剪细胞图像、轮廓和 SQLite 数据库
- 智能标注工具：批量审查和重新标记单细胞或碎片
- 多模式细胞查看：包括荧光叠加、热图、分布图等
- 批量数据分析：导出细胞长度、面积、荧光强度等统计数据
快速开始
- 克隆 GitHub 仓库到本地
- 启动后端服务：在终端中，进入 backend 目录，创建 Python 虚拟环境并安装依赖，运行 python main.py
- 启动前端服务：在另一个终端，进入 frontend 目录，运行 npm install 和 npm run dev
- 通过浏览器访问 http://localhost:3001 进行操作
界面预览
与其他方案对比
| 对比项 | PhenoPixel | 同类方案 |
|---|---|---|
| 自动化程度 | 自动提取细胞轮廓和批量标注，减少手动操作 | 通用图像处理软件可能需要手动标注或编写脚本 |
| 文件格式支持 | 直接支持 ND2 显微镜文件，无缝解析和提取 | 通用软件可能需转换格式或支持有限 |
| 访问方式 | 基于 Web 平台，跨平台访问，无需安装客户端 | 桌面软件需本地安装，可能限于特定操作系统 |
适合谁用
- 进行细菌单细胞显微镜实验的科研人员
- 需要自动化处理 ND2 显微镜图像的生物实验室技术人员
- 研究细胞表型和荧光分布的研究生或博士后
下载与版本
当前最新版本为 v0.1.0，发布于 2026-05-27。支持 Windows、macOS、Linux。
⚠️ 注意：本项目仅提供源代码下载，不包含可直接运行的安装包（exe/dmg/apk 等。下载后需要自行编译构建才能使用，适合有一定开发经验的用户。如果你不熟悉编译流程，建议寻找同类开箱即用的替代方案。
注意事项
- 本工具仅供学习和研究使用，请遵守相关法律法规。
- 请尊重内容创作者版权，勿将下载内容用于商业或非法传播。
- 项目源码地址：https://github.com/ikeda042/PhenoPixel